Après la victoire contre Ghirahim et Xanto, le groupe part pour le château d'Hyrule où se trouve Ganondorf. Ce château a subi quelques changements et est devenu le château de Ganon. Ganondorf prépare un rituel afin d'éveiller totalement la Triforce.
Vous commencez à l'ouest de la fontaine des Fées. Si vous avez choisi Zelda comme personnage, votre précieux allié est Ruto : elle ne doit pas fuir. Cela peut varier d'un personnage à l'autre. Une partie de vos alliés sont au nord. Avant même de prendre les forts, allez combattre le Pyrodactilus qui se trouve au sud-ouest. Dépêchez-vous de l'éliminer pour combattre le deuxième qui se trouve au nord et qui a dû commencer un combat contre des alliés. Vous devez faire en sorte que les deux Pyrodactilus ne se rejoignent pas. Si vous avez fait vite avec le premier, vous pouvez prendre le contrôle du fort de la plaine.
Pendant ce temps, Darunia (on l'avait oublié lui !) envoie un missile teigneux. Il part du fort nord et vous devez le protéger. Pour cela, éliminez tous les gros monstres (maître Stalfos, Lezalfos...) et le Pyrodactilus (si ce n'est pas déjà fait). Le missile teigneux se bloque au fort central, donc prenez le contrôle du fort puis attaquez encore le gros monstre.
Puis le missile explose, vous donnant accès au fort ouest de la plaine. Ganondorf a bientôt fini son rituel. Prenez le contrôle du fort. Une fois le fort pris, Ganondorf rejoint le champ de bataille. Faites attention car il est aussi puissant que Volga en surpuissance ! Ces coups sont dangereux. Éliminez les deux monstres qui l'accompagnent afin d'être tranquille. Gare à la foudre qui vous tombe dessus. Essayez de prendre le contrôle du château. Si vous n'avez pas le temps de faire le tour, combattez tout simplement Ganondorf pour que les portes près de vous s'ouvrent et que vous puissiez prendre le contrôle de ce fort.
Si vous êtes avec Darunia pour ce monde, évitez qu'un de vos alliés s'enfuie afin d'avoir la deuxième Skulltula.
Le château redevient comme avant, mais Ganondorf est toujours là. Les conditions de défaite changent : vous ne devez pas perdre le château, ni votre précieux allié. Avant de vous attaquer à cette partie-là, et si vous avez le bon personnage, n'oubliez pas de récupérer le fragment ou le quart de c?ur. Ne prenez pas trop de temps car Ganon envoie des éclairs sur le château d'Hyrule.
BOSS : GANON
Il va falloir être observateur vis-à-vis de ses attaques. En fonction de son attaque, vous devez utiliser une arme précise. Quand il s'envole, attendez que sa queue brille pour l'attraper avec le grappin. S'il vous balance des graines, utilisez le boomerang. Quand il utilise sa main gauche pour charger une attaque de feu, utilisez les bombes. Pour la main droite, c'est l'arc. Vous n'avez à faire ces actions qu'une seule fois (à part l'action du boomerang).
Votre précieux allié vous donne les flèches de lumière. Attendez que Ganon vous charge, esquivez-le, puis utilisez l'arc. Sinon, attendez que la pierre sur son front brille. N'hésitez pas à utiliser votre magie. Pratiquement tous vos alliés vous aident pour cette bataille.
- CINEMATIQUE -
Ganondorf a perdu et la Triforce sort de son corps. Chaque fragment retourne à son vrai propriétaire. Link, Lana et Zelda l'utilisent sur Ganondorf afin de le sceller à nouveau. Darunia, Fay, Ruto, Machaon et Midona repartent dans leurs mondes. Il ne reste plus qu'à replacer l'épée de légende afin de sceller totalement les ténèbres. Zelda et Link s'occupent de cela, au temple sacré. C'est avec un peu de difficulté qu'ils replacent l'épée de légende dans son socle. Il ne reste plus qu'à reconstruire le château d'Hyrule...
- FIN DE LA CINEMATIQUE -